МБAЛ Пирдоп АД разполага със следните болнични отделения:
- Хирургично отделение
- Вътрешни болести
- Детско отделение – педиатрия
- Отделение по хемодиализа
- Рехабилитация
- Неврологично отделение
- Очни болести
Разполагаме с клинична и микробиологична лаборатория